Server da rack che montano GPU ? La vedo complicata

Ho fatto una prova con AMDOverdriveCtrl e purtroppo funziona solo se collegato al display locale e, tra le altre cose, solo sulla scheda che ha il monitor attivo, o così a me è successo.
Se cerchi di reindirizzare la sessione di X verso un display remoto purtroppo il software ti restituisce l'errore relativo alle librerie.

La soluzione secondo me è provare come suggeriva fansan, installi il server vnc sulla macchina con ubuntu e scarichi il client vnc sul piccì con windows (cerca real vnc su google).
X ubuntu dovrebbe avere il pacchetto per il vnc-server.

Piccola curiosità, sicuro che non riesci a intervenire sul voltaggio con il software di mining ?

Boh... immagino che l'OS della macchina da cui controlli il software sia un windows XX.

Quello che ti serve è un emulatore di X server locale, a cui far agganciare la sessione di amdoverdrivectl.
Non l'ho mai fatto con quello specifico applicativo, ti parlo di software linux che utilizzano in generale un server X, la teoria di base è uguale per tutti .

Ti consiglio di dare un'occhiata QUI:
- xming è un X server per sistemi windows molto leggero e facile da usare.
- putty è un diffusissimo client ssh con svariate opzioni.

E' possibile che tu debba modificare il file /etc/ssh/sshd_config su xubuntu abilitando la voce X11Forwarding

Dopo la modifica riavvia il demone di sshd, solitamente con /etc/init.d/sshd restart (utenza root)

Questo potrebbe essere un problema di alimentazione non adeguata.

Per il resto prova a postare i parametri con cui lanci cgminer

Bon, allora il driver è vecchio e non supporta la scheda, devi usare gli ultimi catalyst dalla AMD.
Hai già cercato qualche guida? Con "xubuntu r9 290" su google la prima risposta che esce è "usare cgminer su ubuntu con una r9 290" e ti spiega passo passo.

Hai il modulo del kernel caricato ?
Fai un dovresti avere la voce fglrx nell'elenco che ti appare

Guarda, te lo dico da uno che è riuscito ad ottenere un "finanziamento regionale" e nemmeno a fondo perduto.
Devi passare tramite apposite agenzie (che ovviamente poi ti mostrano la parcella), solitamente è co-finanziato da un istituto di credito (leggi banca) che ovviamente li rivuole indietro ma soprattutto, prima di ricevere il finanziamento ce li devi mettere di tasca tua, ovvero: prima apri l'attività, comperi il materiale e poi fatture alla mano puoi provare ad ottenere il finanziamento.

Ovviamente ti auguro ogni bene per la tua attività ma restiamo coi piedi per terra sui finanziamenti Italia/Europa 

Ogni macchina che sta minando deve avere attivo cgwatcher che fa il "monitor" del lavoro dell'hardware locale.
La macchina che controlla il lavoro di tutte le altre deve avere a bordo cgremote.

Il link che ho postato è una semplice pagina PHP che puoi copiare in un web server e poi aprire con il browser.
Se utilizzi windows puoi installare apache2 (il web server) e php che sono open source e sono multipiattaforma.

Non sono troppo pratico della netiquette di questo forum e non so se posso postare link al software in questione, comunque lo trovi facilmente su google apache+php sono usatissimi.

CGWatcher lavora solo sulla macchina locale, avvia il processo di mining da un path locale e lo tiene "monitorato".
Le opzioni di "remote" che trovi servono per far si che CGRemote ( a pagamento ) possa controllare i diversi CGWatcher installati.

Edit: in alternativa ho trovato questo simpatico post https://bitcointalk.org/index.php?topic=222632.0 con un'interfaccia che ora passerò a provare.