必ずしも専用ウォレットを作る必要はないと思います。
ウォレットをいろいろ落としているとセキュリティソフトが反応して不安になることもあります。
信頼の置ける取引所なら取引所に置いたままでも良いと思います。
ウォレットと取引所とどっちが安全かは扱いによって変わると思うので各自の判断で選ぶ必要があります。

クリプトフォリオにウォレットに移動させた通貨を反映させるのは、ウォレット内の通貨数を入力するだけで良いと思います。
取引所からウォレットに移動させるときに手数料で少し減ってしまうと思うのでそれを修正するだけです。
クリプトフォリオは基本的に取引所のペアで入力しなければならず、PoSで手に入れたものやもらったりしたものを入力すると
資産推移がおかしくなるので、もう少し融通が利けば便利なのになと思っています。