Для чего ставить сторонний софт? сейчас у всех все настройки банальный батник.
По каким критериям определяется наиболее профитная монета? Давно заметил, что на многих подобных пулах с десяток монет, а майнят круглый год один лайт когда как пол майнеров манят другие валюты.
А "майнера" Вы сами написали?

(если я правильно понял вопрос о стороннем софте)
Непосредственно майнинг, переключается на наиболее дорогую "монету" по результатам котировок на бирже и ее текущей сложности. Анализ происходит каждую минуту. Вот сейчас, к примеру, майнится Feathercoin.
http://unionminer.com/connectБиржа для анализа - Cryptsy.