Гуй утилитка "AMDOverdriveCtrl" - регулировка частоты GPU, частоты Memory, напряжения GPU (ограничена тем что в БИОСе зашито).
запуск или из меню (тогда только первую карточку увидите) или из км.строки с параметром "-i _индекс_адаптера_для_управления_".

Или утилитка для ком.строки только - "aticonfig" - регулировка частоты GPU, частоты Memory.

Вентилятор не ставил бы на 100% сразу - погоняйте... посмотрите...

Это и есть Ваша проблема - 2 видюхи = 2 майнера НЕ = 3 майнера.
Скорее всего 3ий Ваш майнер копает на процессоре (отсюда и тормоза).

Чем копаете то?
Если ГУИ - ПОСМОТРИТЕ внимательно на каждой вкладке копателя - "а не процессором ли копает, гад?".

Также для карты к которой подключен монитор - НЕ стоит ставить большую агрессию ("-f 0" у ГУИ, "AGRESSION=11" у PHOENIX).

Вообще - начните по шагам наcтраивать
1 - 1 копателя запустили
2 - второго
3 - третьего
....

Linux изучать не надо (нам, шахтерам) - найдите тему LinuxCoin на этом сайте - и вперед (английский правда придется хотя бы с переводчиком осваивать)!