Eu não uso MultiBit, mas você tem que copiar um ficheiro que se deve chamar wallet.dat para um lugar seguro, depois de formatar volta a copiar o wallet.dat para o sitío onde estava (Depois de instalar o tal MultiBit)...
Método simples:
Criar uma carteira/conta no Blockchain.info e passar todos seus Bitcoins para lá. (Recomendado)
Ou então seguir a sugestão do pafu...
Método simples-médio:
Encontrar algum ficheiro que se chame wallet.dat e copiar para um lugar seguro (E secreto)
(Recomendado)
Método médio-difícil:
Copiar as Public-Keys e Private-Keys dos endereços para um lugar seguro...