Se l'ordine è passato in filled significa che qualcuno ha "accettato" in parte la tua offerta e ti ha venduto gli eos. Gli eth in eccesso (che se ho capito bene cosa intendi sono quelli che non hai venduto per comprare eos) dovrebbero essere rimasti nel tuo conto insieme agli eos effettivamente acquistati. Una volta eseguita l'operazione d'acquisto non puoi tornare indietro ma ovviamente puoi rivendere gli eos acquistati al mercato.
Il meccanismo dell'ordine parzialmente eseguito penso sia chiaro a _CryptoMan, quello che lui sta segnalando è che non riesce né a cancellare la parte di ordine rimasto ineseguito né a disporre degli eth/eos che sono stati scambiati per effetto dell'ordine parziale.
In effetti è molto strano quel che è successo, personalmente non ho esperienze da riportare (pur usando ogni tanto Bitfinex).