Der Unterschied ist meist sehr groß. Benutzt man nur eine Vorlage und man ändert kaum was ab, hat man eigentlich nur ein Clone erstellt. Die meisten Clone Coins sind zu 90% nutzlos. Außer man verändert einen großen Teil des Codes und bringt wirklich gute Änderungen in den Coin, dann ist der nutzen definitive größer, als wenn man einfach nur ein normalen Clone erstellt.
Das Erstellen von was komplett neuem ist meist ein guter Weg, um zu zeigen, dass das Projekt mehr Potenzial hat, als ein reiner Clone Coin. Dieses wieder rum erhöht aber die Gefahr, das man in dem komplett neuem Code neue Fehler oder Schwächen einbaut, die in den bereits existierenden Coin nicht vorhanden sind. Aber auch wenn man ein Coin komplett neu erstellt, ist es keine Garantie dafür, das dieses Projekt auch Erfolg hat oder z.B. besser ist als die bereits bekannt Coins.
Diese Personen nennt man an sich die Entwickler oder Programmierer. Im englischen, also "Developer (abkürzung, dev)". Hoffe, damit konnte ich deine Fragen so grob beantworten.
EDIT: Hadrop.Boyle war etwas schneller mit der Antwort.