De verdade, esse negocio de esperar mais do que 3 confirmações na rede é mais algo para deixar o usuário esperando de propósito do que por segurança, ja que nunca teve nenhuma transação "revogada" depois de mais de duas confirmações, até porque existem até lugares onde o numero de confirmações para depositar é menor dependendo da conta que você tiver.
Tinha ideia que já tinham havido reorganizações a revogarem mais do que duas confirmações.
Mas independentemente de esperarem por três ou seis confirmações, o que eu acho que não faz muito sentido é esperarem o mesmo número para diferentes moedas - seis confirmações em LTC (por exemplo) são muito menos seguras do que seis confirmações em BTC.